Coraux et éponges sont déjà bien représentés dans les collections initiales du muséum.

Les cornes de ce trophée sont celles d’un buffle sauvage, capturé lors d’une chasse par Paul Proust de la Gironière (1797-1864). Ce dernier, chirurgien navigant, aventurier installé à Manille aux Philippines, les confie à l’équipage de « La Théthis » qui fait escale à Manille lors de son voyage autour du monde entre 1824 et 1826.
Dubuisson, conservateur du muséum les récupère et fait réaliser en 1827 « un os frontal figuré en bois pour porter les cornes du Bufles (sic) de Manil (sic) donné par M. Proust ». Quant au naturaliste qui a exécuté ce trophée, on devine qu’il n’a jamais vu de buffle puisque les cornes sont montées à l’envers : droite à gauche et devant derrière !

Rédigé par François-René Dubuisson et imprimé à Nantes, ce catalogue répertorie les différents objets de collection présentés dans son cabinet d’histoire naturelle.
Tel que précisé sur la page de titre, ce cabinet contenait une collection de minéralogie, quadrupèdes, mammifères et ovipares, ornithologie (1), conchyliologie (2), crustacées, oursins, polypiers marins, ichtyologie (3), entomologie (4) et divers ouvrages de l’art.
Les lettres et les chiffres, en marge de chaque article, sont ceux que portent les différentes pièces du cabinet, pour en faciliter la recherche et l’observation.
(1) oiseaux
(2) coquilles
(3) poissons
(4) insectes

Sur ces cartes géognostiques à l’échelle1/345 000 ème, sont tracées les grandes voies de circulation (routes royales et départementales) et les principaux cours d’eau. La position des localités est assez approximative. 19 zones sont identifiées correspondants à 19 terrains repérés de « A » à « T ».
Pour Dubuisson, le terrain primitif est formé de micaschiste alternant avec le gneiss et le granite avec des roches subordonnées.
Les cartes précisent les gisements métalliques, les sources d’eau minérale, les forges et signalent la présence d’argile et les fabriques de poterie.
Ces cartes sont l’illustration du catalogue de la collection minéralogique recueillie et classée par Dubuisson en 1830. Cette collection est riche d’environ 2 000 échantillons classés par commune.

Publié à partir de 1823, le lycée armoricain était consacré exclusivement à la philosophie, aux sciences physiques et naturelles, à la littérature et aux beaux arts.
Louis-François de Tollenare (1780-1853) participe à l’édition de cette revue par des articles réguliers. En 1824, il y publie des notes rassemblées lors d’un voyage en Suisse.
En visitant le muséum d’histoire naturelle de Genève, il déclare ne pas y trouver « en minéraux des Alpes des richesses comparables à celles que Monsieur Dubuisson a réunies à Nantes en minéraux de Loire-Inférieure ». Il se dit en revanche agréablement surpris par la collection de quadrupèdes et d’oiseaux de Genève.

Membre de la société académique à partir de 1820, Louis-François de Tollenare a fait don en 1824, au muséum de Nantes, d’un plan relief des Alpes.
Sans doute acheté lors de son voyage en Suisse en 1823, ce plan exécuté au début du 19 ème siècle, représente, selon une étiquette rédigée par Dubuisson, une partie des Alpes et du Jura (lac de Genève et ses environs) : « Il s’étend du revers méridional du Mont Blanc au lac de Joux et de la porte du Rhône aux hautes montagnes de Gruyère ».
Une lettre du 7 octobre 1824 de Dubuisson au maire Ferdinand Favre précise qu’ « il serait à propos que ce plan fut placé sur un socle et mis sous verre ».
Après être longtemps tombé dans l’oubli, le plan relief est restauré à l’atelier de Kerguehennec (56) en 1998. Sculpté dans un bloc de bois résineux, les couleurs sont appliquées sur une mince préparation blanche ; la polychromie a été en grande partie restaurée.

À l’initiative de la Municipalité, une commission avait été formée pour surveiller la conservation des collections et donner un avis sur les acquisitions, l’exposition et le placement des objets.
F.R.A. Dubuisson écrit une lettre à Ferdinand Favre, Maire de Nantes, dans laquelle il déplore qu’autant de pouvoirs soient confiés à cette commission et expose les raisons de ses désaccords. Alors malade, il supporte mal les recommandations de la commission de surveillance, en particulier les reproches concernant les oiseaux alors que cette collection lui aurait permis d’initier le Couëronnais Jean-Jacques Audubon : « [...] et c'est avec cette collection ainsi classée, dis-je encore, que Monsieur Audubon, célèbre ornithologiste, a été initié par moi à cette science qui fait aujourd'hui sa gloire… »